Российские исследователи разработали новый подход к изучению ДНК. По их мнению, этот метод можно применять для прогнозирования рисков заболеваний — например, наследственных дефектов, устойчивости к инфекциям, склонности к аутоиммунным патологиям и других — а также для диагностики как у людей, так и у животных; кроме того, он полезен в животноводстве для точной идентификации пород, сообщили в Российском научном фонде (РНФ). В геноме существуют участки, появляющиеся из-за того, что оба родителя передают потомству одинаковые варианты (аллели) генов. Такие участки, называемые гомозиготными, играют важную роль в генетической структуре популяций. Анализ гомозиготных фрагментов ДНК помогает ученым восстановить историю скрещиваний между родственными особями (инбридинг) и оценить влияние процессов естественного и искусственного отбора на популяцию, пояснили авторы работы, опубликованной в журнале Biology. Новый инструмент для исследования сложных устойчивых сочетаний генов предложили специалисты Донского государственного аграрного университета (ДГАУ) и Всероссийского научно-исследовательского института племенного дела, объединив геномный анализ, визуализацию и методы глубокого обучения нейросетей. Как отмечают исследователи в сообщении РНФ, предложенный подход открывает новые возможности для селекции продуктивных и здоровых животных. «Наша технология представляет собой важный шаг к следующему поколению цифровой генетической диагностики в животноводстве и медицине. Метод позволяет наглядно и точно оценивать генетическую предрасположенность к ключевым признакам — от породной принадлежности до риска наследственных заболеваний», — рассказала руководитель проекта, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетической экспертизы ДГАУ Мария Колосова, цитата которой приведена в сообщении РНФ. В рамках исследования ученые проанализировали генетические данные двух пород свиней — крупной белой и дюрок. У свиней крупной белой дополнительно изучали наличие либо отсутствие дефектов конечностей, разделив животных на группу с патологиями и группу здоровых особей.